与之前的《口袋小精灵》系列游戏相同，游戏记录了一位年轻的口袋小精灵训练家训练口袋小精灵、进行口袋小精灵对战并挫败敌对组织计划的故事。两个版本彼此*，但剧情基本相同，玩家可以*游戏并交换限定的口袋小精灵以收集口袋小精灵图鉴。